环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?
近几年关于 circRNA 的研究如火如荼,当前,我们也已经对 circRNA 有个大概的认识,比如什么是 circRNA、它是
怎么形成的以及它在不同物种不同组织中普遍存在。据 circBank 的不完全统计,人类细胞和组织中大约发现了 14 万条
circRNA转录本。这么多的 circRNA 到底具有什么样的功能呢,其实最终的问题是它对我们人类有什么用呢?有钱且疯狂
的中国研究者不惜将人类所有疾病都测序一遍,最后发现 circRNA 分子确实在疾病中差异表达了。
既然有差异表达了,那究竟有什么影响呢?先来看看circRNA是什么?
1. circRNA(circular RNA,环状RNA)是一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子,没有5′ 帽子结构和3′ poly
(A)结构,主要位于细胞质或储存于外泌体中,不受RNA外切酶影响,表达更稳定且不易降解,已被证明广泛存在于
多种真核生物体内。
2. 根据环状RNA剪接来源的不同,将其分为外显子环化形成的环状RNA(exonic cirRNAs)和内含子环化形成的
环状RNA(cirRNAs)。大多数circRNA是由外显子环化而成,也有部分circRNA是由内含子环化而成的套索结构
(lariat)。同时由于circRNA含有大量的miRNA应答原件(MREs),能与AGO蛋白形成RNA诱导沉默复合体(RISC)
的催化核心,最终导致circRNA降解。
按来源归类CircRNA的种类
①全外显子型的circRNA;
②内含子和外显子组合的EICircRNA;
③内含子组成的套索型ciRNA;
④由病毒RNA基因组、tRNA、rRNA、snRNA等环化产生的circRNA。
circRNA生物学功能
circRNA主要存在于细胞质或外泌体中,具有组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征。近几年,大
量的研究表明circRNA在生物的生长发育、胁迫应答、疾病发生和发展等方面密切相关,并预测其在疾病诊断标记物等方
面的应用前景,但其生物学功能在很大程度上仍然未知。目前认可度比较高的circRNA生物学功能,归类如下:
1. miRNA sponge:circRNA富含miRNA结合位点来充当miRNA海绵作用,阻止miRNA在3′ 非翻译区与mRNA相互
作用,进而间接调控miRNA下游靶基因的表达。
2.调控蛋白结合:circRNA通过与mRNA调节的结合蛋白(RBP)结合,进而改变剪接模式或mRNA稳定性。
3.调控基因转录:circRNA与RNA聚合酶Ⅱ相互作用并调节转录,或者EIcircRNA可与小核糖核蛋白互作用,再与RNA聚
合酶Ⅱ结合。
4.编码功能:circRNA虽然属于非编码RNA,但也有部分circRNA可被核糖体翻译并编码多肽,进而行使调控功能。
技术流程
服务优势
1.成环效率好,稳定性高
circRNAs 表达载体上加有艾基生物独家研发的上下游环化框架,对各种长度的目标序都有很好的环化效果;目前验证过的
所有 circRNAs 环化效率都在50% 以上,能有效保证至少100倍以上过表达效率。
2.便捷服务
可提供预测circRNA编码能力,提供circRAN的ID号,物种即可,订购构建服务,免费赠送1ug总量的阴性对照质粒。
3.序列环化准确
环化框架内部引入的特异环化介导序列可有效保证目标 circRNAs 的线性序列精确环化。
4.系统多样性高
可提供基于细胞瞬时,慢病毒的表达系统;也可提供表达GFP荧光或着嘌呤霉素等抗性基因的系统,以便利于筛选。
现有环化载体
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