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微生物菌种鉴定

服务介绍  Service Introduction



          细菌的 rRNA 是细胞内含量最多的 RNA,约占 RNA 总量的 80% 以上,由高度保守区和可变区组成。

        细菌的 rRNA 包括 5S、 16S、 23S,其中 5S rRNA 信息量少,不适合分析。23S rRNA 尽管分子大,信息量多,但碱基突变速度较快,同样不适用于细菌鉴定。16S rDNA 是编码原核生物核糖体小亚基 16S rRNA的 DNA 序列,相比之下遗传较为稳定,长度在 1550±200 bp 左右,信息量适中,可以用于研究系统进化。目前已经报道了 10,000 种以上的细菌 16S rDNA 序列。 16S测序是细菌菌种鉴定的金标准。 

 

技术流程 Technical Procedures



图片3 

 

图片4 

16s rDNA 示意图 



样品要求及注意事项 Sample Requirements And Notes 



  •    基因组 DNA:OD 260/280 在 1.8-2.0 之间(OD260/230 最好大于 1.5),浓度 ≥ 30 ng/μl, 体积 ≥ 20 μl,且无明显降解; 

  •    建议提供培养过的菌液,体积 >2 ml,请确保提供的菌液是经过分离培养的单菌落,因样本不纯造成的测序双峰,将全额收取实验费用;

  •    特殊样品 , 如放线菌、厌氧菌等,请直接提供基因组 DNA,革兰氏阳性菌,建议提供基因组 DNA;

  •    不接受有致病性的样品 , 如果菌体带有致病性,请提供基因组 DNA,并进行加热处理以杀死致病菌;

  •    由于有些真菌形态与细菌相似,难以判断,在无法获得 16S rDNA 结果时,建议考虑进行真菌 ITS 区序列分析; 

  •    对于测序双峰的样本,可以提供克隆测序的服务。

 

交付结果  Results Delivery


  •    测序峰图及序列文件 

  •   16S rDNA 序列拼接文件 

  •    序列分析比对结果 


增资服务 Additional Service



 对于测序双峰的样品,可提供克隆测序服务,价格:380 元 / 样品; 包含:片段克隆,6 个阳性克隆测序,序列比对分析。


 

资料下载


细菌16SrDNA菌种鉴定服务委托书


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