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服务介绍  Service Introduction




        随着高通量测序成本的大幅度降低以及测序效率的大幅度提升,使得目前进行全基因组重测序成为一种用来查找变异的常规手段,重 测序是对已知基因组的物种的不同个体或同一个体的不同组织进行全基因组测序,通过与参考基因组比较分析,获得个体基因组的序列信 息,得到与参考基因组的各种变异信息,例如 SNP、InDel、SV 、CNV 等变异信息,对获得遗传变异的致病基因、了解群体遗传学以及 物种的进化过程、进行自然选择等研究具有重要的意义。

 

技术流程 Technical Procedures




       利用物理方法将基因组 DNA 进行随机打断后,根据建库所需片段大小进行回收,利用标准的 Illumina 建库流程构建小片段测序文库, 采用 150PE 模式进行测序,总体的测序深度在 30×,但根据不同的实验测序要求测序深度可以进行调整。

 

图片18 

 

 

生物信息学分析 Bioinformatics Analysis



图片19 

 

样品要求  Sample Requirements




实验类型

DNA样品总量

样品浓度和纯度

样品保存

样品选择

动植物基因组重测序

≥1 μg

样品浓度 >50 ng/μl,OD260/280 介于 1.8-2.0 之间,无肉眼可见杂质污染,基因组完整、无降解,电泳中 DNA 主带应大于 23 kb

请选择干粉、酒精、TE 或超纯水的保存方式

对于植物样品建议选取黑暗培养的黄化苗或嫩苗,动物样品应选择肌肉、血等脂肪含量较少的组织进行取样

 


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